蓝莓品种ISSR指纹图谱构建的初步研究

郑姗; 张立杰; 谢丽雪; 张小艳; 李韬

doi:10.19303/j.issn.1008-0384.2014.12.008

蓝莓品种ISSR指纹图谱构建的初步研究

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2014.12.008

福建省农业科学院果树研究所,福建福州,350013

基金项目:

福建省种业创新与产业化工程项目 (2014S1477-22)

福建省农业科学院导师制青年科技创新基金项目 (2013DQB-9)

详细信息

作者简介:
郑姗 (1983-) , 女, 硕士, 助理研究员, 主要从事果树分子生物学与遗传育种 (E-mail:trista1028@sina.com);李韬 (1969-) , 男, 副研究员, 主要从事植物保护与果树分子生物学 (E-mail:leetao06@163.com)

中图分类号: S663.9
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出版历程
- 收稿日期: 2014-10-25
- 刊出日期: 2014-12-18

DNA Fingerprinting by ISSR Markers for 17 Blueberries

Fruit Research Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences

摘要

摘要: 利用ISSR分子标记技术分析17个蓝莓品种的遗传多样性, 并构建DNA指纹图谱。从60个ISSR引物中筛选出10个稳定的多态性引物。采用NTSYS-PC 2.0软件进行聚类分析, 17个蓝莓品种的遗传相似系数为0.66⁰.86, 在0.69的水平可分为4个品种群。引物UBC825、UBC862可将17个蓝莓品种区分开, 并依此建立了数字化的DNA指纹图谱, 为蓝莓品种分类、快速鉴定提供依据。
- 蓝莓 /
- ISSR /
- 指纹图谱 /
- 遗传多样性
Abstract: Inter-simple sequence repeat (ISSR) analysis was applied for the determination of the genetic diversity, as well as the establishment of the DNA fingerprints, for 17 selected blueberry cultivars.Ten out of 60 ISSR primers were chosen for the study.Cluster analysis revealed that the genetic similarity coefficients of the 17 samples ranged from 0.66 to 0.86.Using the coefficient threshold of 0.69, 4classifications were formed for the blueberries.They could be positively distinguished by 2ISSR primers (i.e., UBC825 and UBC862) , and used to obtain the digital DNA fingerprints.
- blueberry /
- ISSR /
- fingerprint /
- genetic diversity

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参考文献(14)

[1]	宣继萍, 章镇, 房经贵, 等.苹果品种ISSR指纹图谱构建[J].果树学报, 2002, 19 (6) :421-423.
[2]	刘威生, 冯晨静, 杨建民, 等.杏ISSR反应体系的优化和指纹图谱的构建[J].果树学报, 2005, 22 (6) :626-629.
[3]	雷天刚, 何永睿, 吴鑫, 等.柑橘栽培品种 (系) DNA指纹图谱库的构建[J].中国农业科学, 2009, 42 (8) :2852-2861.
[4]	范付华, 杨勇胜, 李庆宏, 等.利用ISSR分析技术鉴定贵州枇杷新种质的研究[J].北京林业大学学报, 2012, 34 (4) :52-57.
[5]	郑姗, 张立杰, 张小艳, 等.龙眼新品种 (品系) 的ISSR指纹图谱研究初探[J].福建农业学报, 2012, 27 (12) :1308-1312.
[6]	张冰雪, 范付华, 乔光, 等.贵州地方火龙果芽变种质DNA指纹图谱及遗传多样性的ISSR分析[J].果树学报, 2013, 30 (4) :573-577.
[7]	谢玥, 潘美玲, 庄启国, 等.红阳猕猴桃及其杂交后代的ISSR指纹图谱构建及遗传多样性分析[J].基因组学与应用生物学, 2013, 32 (1) :76-82.
[8]	BOCHES P, ROWLAND L J, BASSIL N V.Microsatellite markers for Vaccinium from EST and genomic libraries[J].Mol Ecol Note, 2005, 5:657-660.
[9]	GIONGO L, VENDRAMIN E, QUARTA R et al.Use of RAPD Analysis to Charaeterize Vaccinium Aeeessions[J].Acta Hort, 2006, 715:153-156.
[10]	於虹, 顾姻, 贺善安, 等.越橘品种的ISSR鉴定及其亲缘关系分析[J].吉林农业大学学报2009, 31 (5) :512-515.
[11]	尹德洁.蓝莓野生资源和SRAP遗传多样性研究[D].北京林业大学硕士学位论文, 2012.
[12]	GILBERT J E, LEWIS R V, WILKINSON M J, et al.Developing an appropriate strategy to assess genetic variability in plant germplasm collections[J].Theoretical and Applied Genetics, 1999, 98 (6-7) :1125-1131.
[13]	崔建民, 刘红霞, 邹荣仟, 等.越橘种质资源遗传多样性和亲缘关系研究[J].果树学报, 2010, 27 (3) :373-378.
[14]	LYRENE P M.Low-chill highbush blueberries[J].Fruit Varieties Journal, 1990, 44:82-86.