芙蓉李PsACO1基因的克隆与生物信息学分析

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芙蓉李PsACO1基因的克隆与生物信息学分析

方智振, 周丹蓉, 叶新福, 姜翠翠, 潘少霖

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方智振, 周丹蓉, 叶新福, 姜翠翠, 潘少霖. 芙蓉李PsACO1基因的克隆与生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

引用本文:

方智振, 周丹蓉, 叶新福, 姜翠翠, 潘少霖. 芙蓉李PsACO1基因的克隆与生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

FANG Zhi-zhen, ZHOU Dan-rong, YE Xin-fu, JIANG Cui-cui, PAN Shao-lin. Cloning and Bioinformatic Analysis of PsACO1 gene from Furong Plum(Prunus salicina Lindl.)[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

Citation:

FANG Zhi-zhen, ZHOU Dan-rong, YE Xin-fu, JIANG Cui-cui, PAN Shao-lin. Cloning and Bioinformatic Analysis of PsACO1 gene from Furong Plum(Prunus salicina Lindl.)[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

方智振, 周丹蓉, 叶新福, 姜翠翠, 潘少霖. 芙蓉李PsACO1基因的克隆与生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

引用本文:

方智振, 周丹蓉, 叶新福, 姜翠翠, 潘少霖. 芙蓉李PsACO1基因的克隆与生物信息学分析[J]. 福建农业学报, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

FANG Zhi-zhen, ZHOU Dan-rong, YE Xin-fu, JIANG Cui-cui, PAN Shao-lin. Cloning and Bioinformatic Analysis of PsACO1 gene from Furong Plum(Prunus salicina Lindl.)[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

Citation:

FANG Zhi-zhen, ZHOU Dan-rong, YE Xin-fu, JIANG Cui-cui, PAN Shao-lin. Cloning and Bioinformatic Analysis of PsACO1 gene from Furong Plum(Prunus salicina Lindl.)[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2015, 30(2): 136-140. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

芙蓉李PsACO1基因的克隆与生物信息学分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2015.02.006

福建省农业科学院果树研究所

基金项目:

福建省科技重大专项专题(2013NZ0002-1)

福建省财政专项——福建省农业科学院科技创新团队建设项目(CXTD-1316)

作者简介:
方智振(1985-),男,博士,助理研究员,主要从事果树生物技术与遗传育种研究(E-mail:fzhzh2008@163.com);叶新福(1967-),男,博士,研究员,主要从事作物品质遗传育种研究(E-mail:yexinfu@126.com)

中图分类号: S662.3
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出版历程
- 收稿日期: 2015-01-02
- 刊出日期: 2015-02-18

Cloning and Bioinformatic Analysis of PsACO1 gene from Furong Plum(Prunus salicina Lindl.)

Fruit Research Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences

Funds:

福建省农业科学院果树研究所,福建福州,350013

摘要: 采用RT-PCR和RACE技术从芙蓉李分离得到1条长度为1 309bp的PsACO1基因cDNA全长序列。该基因包含长度为957bp的开放阅读框,编码319个氨基酸。PsACO1蛋白的分子量为36.24kD,等电点为5.28,含有9个ACO特有的保守结构域。系统进化分析结果表明PsACO1与碧桃、梅、枇杷、苹果和欧洲李的ACO蛋白的亲缘关系较近。
- 李 /
- 1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶 /
- 基因克隆 /
- 生物信息学
Abstract: A 1309 bp full length cDNA sequence of PsACO1 gene were isolated from Furong plum(Prunus salicina Lindl.)through RT-PCR and RACE technology.The isolated gene contains a 957 bp open reading frame and encodes a protein of 319 amino acids with isoelectric point of 5.28 and molecular weight of 36.24 kD.PsACO1protein contains characteristic domains of ACO proteins.The phylogenetic analysis results showed that PsACO1 has close corelation with ACO protein fromPrunus persica,Prunus mume,Eriobotryajaponica,Malus domestica and Prunus domestica.
- Plum /
- ACO /
- gene cloning /
- bioinformatics

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