SRAP-marker Based Genetic Diversity of Germplasms of Cymbidium Hybrids
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摘要: 采用SRAP技术对24份杂交兰种质资源的遗传多样性进行分析。筛选出的11对引物组合共扩增出119条谱带，其中102条为多态带，多态性比率86.1%，平均每对引物组合产生9.3个多态性位点。各种质之间的相似系数变化范围为0.43~0.98，平均为0.67。UPGMA聚类分析表明：在遗传相似系数0.69处将24份供试材料划分为5个类群，较好地揭示了杂交兰种质间的遗传多样性与亲缘关系，可为杂交兰种质资源利用、杂交育种亲本选择及杂种后代鉴定提供科学依据。Abstract: SRAP was applied for the determination of the genetic diversity of 24 hybrid cultivars of Cymbidium. Eleven polymorphic primer combinations were screened to result in 119 amplified DNA bands. Of the amplified DNA, 102 were polymorphic, at a ratio of 86.1%. The average number of polymorphic loci amplified by each primer was 9.3. The genetic similarity among the 24 germplasms ranged from 0.43 to 0.98, averaging 0.67. The UPGMA cluster analysis classified the germplasms with a similarity coefficient of 0.69 into 5 groups clearly showing the genetic diversity and relationship among the hybrids.
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Keywords:
- Cymbidium hybrid /
- SRAP /
- genetic diversity /
- cluster analysis
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图 1 24个杂交兰种质的SRAP 扩增图谱
注:A为引物Me3+Em3；B为引物Me6+Em2；M为Marker DL-2000；1~24为种质的编号。
Figure 1. SRAP patterns of 24 Cymbidium hybrid germplasms amplified by primer combination Me3+Em3 and Me6+Em2
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图 2 基于SRAP 标记的聚类分析
Figure 2. UPGMA dendrogram of 24 Cymbidium hybrids based on SRAP marker
表 1 杂交兰供试材料
Table 1 Cymbidium hybrids examined
序号 品种 花部等特征 1 绿翡翠C. ‘Green Jade’ 黄绿色、素心，微香 2 黄金小神童 C. Golden Elf‘Sundust’ 黄花素心，浓香 3 十八格格C. ‘Eighteen Princess’ 花瓣青黄色，唇瓣白色、有淡粉色虎斑，清香 4 韩国小姐 C.‘Miss Korea’ 花瓣桃红色具纵纹线，唇瓣带红色虎斑，淡香 5 爪艺韩国小姐 C.‘K32-1’ 花瓣桃红色具纵纹线，叶片爪艺 6 韩国桃花C.‘Korea Peach’ 花瓣铜红色具纵纹线，唇瓣黄色带暗红虎斑 7 黄金美人C.‘Golden Beauty’ 黄花素心，荷瓣，浓香 8 紫元素C.‘Purple Element’ 花瓣红褐色，彩心，清香 9 红美人C.‘Red Beauty’ 花瓣暗红色，唇瓣基部为黄色，微香 10 K33a红美人C.‘K33a’ 花瓣暗红色，唇瓣基部为黄色，微香 11 醉美人C.‘Drunk beauty’ 花瓣橘红色、基部具红色斑块，浓香 12 金玉满堂C.‘K36’ 花瓣橙红色带胭脂红斑纹，浓香 13 台北小姐 C.‘Miss Taipei’ 粉红色带紫红条纹，唇瓣具深红斑，清香 14 东方快车 C.‘Orient Express’ 米黄色带紫红条纹，唇瓣具红色斑块，清香 15 樱花 C.‘K40’ 粉红色花，荷瓣 16 K40-2樱花 C.‘K40-2’ 粉红色花，荷瓣 17 夏日香水C.‘Summer perfume’ 花瓣青黄色，唇瓣带深红斑块，浓香 18 西施 C.‘xisi’ 花瓣红色带深红色条纹 19 金龙爪C.‘K18-1’ 深黄，唇瓣具更深黄色斑，叶片爪艺， 20 立叶大凤C.‘Liyedafeng’ 金黄色素花，微香 21 黄金龙C.‘K18’ 黄色素花，微香 22 华韵丹霞C.‘Huayundanxia’ 深红色带胭脂红斑，微香 23 华韵红霞C.‘Huayunhongxia’ 鲜红色带胭脂红斑，微香 24 玉凤C.‘Yufeng’ 青黄色素花，微香，微香 
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表 2 SRAP 引物组合的扩增结果
Table 2 Results and polymorphism of SRAP primer combinations
引物名称 引物序列(5′-3′) 扩增
条带数多态性
带数多态性
比率/%Me2+Em9 TGAGTCCAAACCGGAGC
GACTGCGTACGAATTACG12 10 83.3 Me3+Em3 TGAGTCCAAACCGGAAT
GACTGCGTACGAATTGAC13 10 76.9 Me3+Em5 TGAGTCCAAACCGGAAT
GACTGCGTACGAATTAAC10 8 80.0 Me4+Em7 TGAGTCCAAACCGGACC
GACTGCGTACGAATTATG12 11 91.7 Me5+Em8 TGAGTCCAAACCGGAAG
GACTGCGTACGAATTCTG10 9 90.0 Me5+Em10 TGAGTCCAAACCGGAAG
GACTGCGTACGAATTTAG9 9 100.0 Me6+Em2 TGAGTCCAAACCGGTAA
GACTGCGTACGAATTTGC13 11 84.6 Me6+Em3 TGAGTCCAAACCGGTAA
GACTGCGTACGAATTGAC10 9 90.0 Me6+Em8 TGAGTCCAAACCGGTAA
GACTGCGTACGAATTCTG10 8 80.0 Me7+Em2 TGAGTCCAAACCGGTGT
GACTGCGTACGAATTAGC9 8 88.9 Me8+Em10 TGAGTCCAAACCGGTGC
GACTGCGTACGAATTTAG11 9 81.8 总数 119 102 平均数 10.8 9.3 86.1
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