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As6G-FFT基因烟草的阳性鉴定及基因拷贝数测定

铁原毓, 文军琴, 田洁

铁原毓,文军琴,田洁. 转As6G-FFT基因烟草的阳性鉴定及基因拷贝数测定 [J]. 福建农业学报,2022,37(5):592−599. DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2022.005.006
引用本文: 铁原毓,文军琴,田洁. 转As6G-FFT基因烟草的阳性鉴定及基因拷贝数测定 [J]. 福建农业学报,2022,37(5):592−599. DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2022.005.006
TIE Y Y, WEN J Q, TIAN J. Identification and Copy Number of As6G-FFT in Transgenic Tobacco Plant [J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences,2022,37(5):592−599. DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2022.005.006
Citation: TIE Y Y, WEN J Q, TIAN J. Identification and Copy Number of As6G-FFT in Transgenic Tobacco Plant [J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences,2022,37(5):592−599. DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2022.005.006

As6G-FFT基因烟草的阳性鉴定及基因拷贝数测定

基金项目: 国家自然科学基金项目(31960590);青海省科技厅重点实验室项目(2020-ZJ-Y02);中国科学院“西部之光”项目(2019年)
详细信息
    作者简介:

    铁原毓(1997-),女,硕士研究生,研究方向:蔬菜分子生物学(E-mail:healer2727@163.com

    通讯作者:

    田洁(1986-),女,博士,副研究员,研究方向:蔬菜生理与分子生物技术(E-mail:tiantian8092001@163.com

  • 中图分类号: S 572

Identification and Copy Number of As6G-FFT in Transgenic Tobacco Plant

  • 摘要:
      目的  为验证转As6G-FFT烟草的基因功能,筛选稳定遗传的阳性株系材料,以建立基于SYBR Green的实时荧光定量PCR的转基因拷贝数检测方法。
      方法  利用PCR检测、实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qRT-PCR)技术及生理指标分析鉴定转As6G-FFT基因阳性烟草植株,并利用基于SYBR Green的实时荧光定量PCR鉴定阳性转基因烟草中As6G-FFT基因的拷贝数。
      结果  (1)基于PCR检测,14个转基因烟草叶片均能扩增出目的片段,表明14个株系中均已成功转入目的基因As6G-FFT;(2)14个转基因株系中As6G-FFT基因表达量呈极显著(P<0.01)或极其显著上升(P <0.001),其中6个株系的表达量呈极其显著升高(P <0.001);且其表达量与野生型相比最高提高215.13倍;(3)基于生理指标,测定转As6G-FFT基因烟草的果聚糖含量,发现14个转基因株系中果聚糖含量呈极显著(P <0.01)或极其显著上升(P <0.001),其中13个株系的果聚糖含量极其显著升高(P <0.001);且其果聚糖含量与野生型相比最高提高10.47倍;(4)基于SYBR Green实时荧光定量PCR构建As6G-FFTNtACT基因的标准曲线,分别为y=−0.290 7x+3.014 5和y=−0.2813x+8.0141,R2均为1;在检测的14个转基因株系中As6G-FFT基因拷贝数为1~3,其中1、2和3拷贝的单株数分别占总数的35.7%、50.0%和14.3%。
      结论  本研究从DNA、RNA和生理水平综合进行阳性转基因烟草的鉴定,鉴定结果更为准确。此外,还建立了基于SYBR Green实时荧光定量PCR的转基因烟草中外源As6G-FFT基因拷贝数检测方法,可用于快速、高效地估算转基因烟草中外源基因拷贝数,为后续获得稳定遗传材料提供筛选依据。
    Abstract:
      Objective   Functions, identification, and copy number of As6G-FFT in the transgenic tobacco plants were studied.
      Method   PCR, qRT-PCR, and physiological analysis were performed to confirm the transgenic tobacco plants being As6G-FFT-positive and elucidate the functions of the gene. SYBR green-based qRT-PCR was applied to determine the copy number of the gene in the transgenic plant.
      Result   (1) The target fragment was amplified on the leaves of 14 tobacco plants by PCR assuring a successful transfer of As6G-FFT. (2) In varying degrees, the gene expressions in the 14 transgenic lines were higher than in the wild-type. Six of the lines were extremely significantly higher than the wild-type counterpart, with an accumulation topped 215.13-fold. (3) The fructan contents were higher in the leaves of the transgenic than the wild-type plants. Thirteen of the transgenic lines contained extremely significantly more fructan than the wild-type with the highest accumulation of 10.47-fold. (4) With correlation coefficients of 1, the SYBR green-based qRT-PCR standard curves of y=−0.2907x+3.0145 was obtained for As6G-FFT and y=−0.2813x+8.0141 for NtACT. Of the 14 transgenic lines, 35.7% contained only one of the gene, 50.0% had 2, and 14.3% 3 copies.
      Conclusion   Transgenic tobacco plants with As6G-FFT were identified based on the DNA, RNA, and physiological aspects. The SYBR green-based qRT-PCR method rapidly and efficiently determined the number of exogenous As6G-FFT transferred into the plants and could be a convenient tool for screening and acquisition of stable genetic materials.
  • 【研究意义】果聚糖(Fructan)为水溶性非还原性多糖,是由蔗糖与1个或多个果糖基连接而成的聚合物[1]。果聚糖作为15%被子植物中主要的贮藏性碳水化合物,其代谢与渗透调节、源库关系调节、抗逆性等生理活动密切相关。目前已发现植物中的果聚糖主要有5种类型,其中大蒜果聚糖属于菊糖型果聚糖新生系列。果聚糖:果聚糖6G-果糖基转移酶(6G-FFT)是其合成过程所必需的酶,能够发生特异性反应,催化1-蔗果三糖生成新蔗果三糖[2]。植物转基因技术已广泛应用于基因工程育种,以改善作物品质、提高作物产量、培育植物新品种等。目前转基因技术最为广泛和成熟的方法主要是农杆菌介导法,但农杆菌所携带含有目的基因的T-DNA区域是随机插入受体植物基因组中,因而得到的转基因植株通常含有一个或多个拷贝的外源基因[3]。而转基因植物中外源基因的拷贝数是影响其表达水平及稳定遗传的关键因素,多拷贝的外源基因会直接导致基因沉默或不能稳定表达[4],因此,筛选单拷贝外源基因的转基因植株对后续遗传稳定性起关键性作用。【前人研究进展】近年来,对果聚糖代谢调控基因的功能研究已成为热点。在菊苣中转化洋葱6G-FFT基因后,发现菊苣中含有菊糖型果聚糖新生系列[5]。Gadegaard等[6]将洋葱中的6G-FFT转入黑麦草中,发现果聚糖积累量比对照高3倍。何娜等[7]克隆芦笋Ao6G-FFT基因,对其序列特征进行分析,发现其启动子区域存在响应非生物胁迫的元件。此外,前人研究检测外源基因拷贝数常采用Southern blot技术,但其价格昂贵、耗时较长、灵敏度较低[8]。近年来,研究人员开始利用实时荧光定量PCR技术检测外源基因拷贝数,如王育花等[9]通过实时荧光定量PCR检测了转基因水稻中外源基因拷贝数,在8株检测植株中,得到1株单拷贝的植株。裘劼人等[10]利用SYBR Green实时定量PCR法检测转基因拟南芥中外源基因拷贝数,发现该法计算所得拷贝数与传统高准确性的Southern blot法结果相符。苏慧慧等[11]利用实时荧光定量PCR技术检测转基因樱桃番茄中外源基因拷贝数,发现12株转基因植株内整合的拷贝数为0~20不等,且其中4株在普通PCR中存在假阳性。【本研究切入点】目前,方便快捷、灵敏性强、成本低的实时荧光定量PCR检测外源基因拷贝数的技术逐渐被广泛应用。但鲜见有关大蒜As6G-FFT基因转入烟草的研究报道。【拟解决的关键问题】本研究将从大蒜中克隆的As6G-FFT基因转入烟草中,获得转As6G-FFT基因烟草,然后分别提取测定14株转基因烟草叶片的DNA、RNA及果聚糖含量,以从DNA、RNA及生理水平鉴定阳性单拷贝As6G-FFT转基因烟草,以期为筛选单拷贝的转As6G-FFT基因烟草提供参考依据。

    以组培苗移栽后生长30 d的野生型烟草K326和转As6G-FFT基因烟草为试验材料,取二者的幼嫩叶片速冻于液氮中,置于−80 ℃超低温冰箱中保存,用于基因组DNA和RNA的提取以及果聚糖含量测定。转As6G-FFT基因烟草和野生型烟草 K326均为青海省蔬菜遗传与生理重点实验室保存。

    利用新型植物基因组DNA提取试剂盒和TRNzol Universal试剂(北京天根生化科技有限公司)进行总DNA和RNA的提取,采用Honor™ Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix和Unique Aptamer™ qPCR SYBR® Green Master Mix(北京诺禾致源科技股份有限公司)进行qRT-PCR分析。

    阳性转基因烟草鉴定和荧光定量分析所用引物均使用Primer 5软件设计,引物由上海生工生物工程有限公司合成,引物序列见表1

    表  1  引物序列
    Table  1.  Primer sequence
    引物
    Primer
    引物序列
    (5′-3′) Primer sequence
    目的
    Purpose
    As6G-FFT-clone F: ATGGATGCTCAAGACATTGAG
    TC
    阳性PCR检测
    Positive PCR detection
    R: TTAAAAATGATAAAAATCATTG
    TAAGTGGAGTTC
    As6G-FFT F: TGGCTCTTTACGCACTCA 实时荧光定量
    PCR分析
    qRT-PCR analysis
    R: TCGCACTCGTCCTACCTC
    NtACT F: AATGATCGGAATGGAAGCTG
    R: TGGTACCACCACTGAGGACA
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    采用新型植物基因组DNA提取试剂盒提取1株野生型烟草K326和14株转As6G-FFT基因烟草叶片的基因组DNA,以其为模板,以As6G-FFT-clone为引物(表1),通过PCR扩增鉴定As6G-FFT基因是否导入烟草基因组。扩增产物长度约为1 839 bp,PCR反应体系为2×Taq PCR Mix 12.5 μL,cDNA模板1 μL,上下游引物各1 μL,ddH2O 9.5 μL;反应程序为94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,56 ℃退火30 s,72 ℃延伸2 min,35个循环;72 ℃延伸10 min,扩增产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳分析。

    为了分析As6G-FFT基因在RNA水平的表达情况,对经PCR鉴定呈阳性的转基因植株进行As6G-FFT转录水平分析。利用TRNzol Universal提取总RNA,检测RNA的质量和浓度后,检测合格的RNA样品利用Honor™ Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR反转录为cDNA。以测试烟草的cDNA为模板,以烟草Actin基因特异引物NtACT和大蒜6G-FFT基因特异引物As6G-FFT对各样本一起进行扩增,引物序列详见表1。反应体系为Unique Aptamer Green Matser Mix 10 μL,cDNA模板1 μL,上下游引物各0.6 μL,ddH2O 7.8 μL;反应程序为94 ℃预变性5 min;95 ℃ 30 s,56 ℃ 1 min,72 ℃ 2 min,35个循环;72 ℃延伸10 min,重复3次。

    果聚糖的提取及含量测定参考田洁等[12]的方法进行。利用高效液相色谱仪(日本岛津RID-10A)进行测定,采用Shodex SUGAR KS-801串KS-802色谱柱,示差检测器,以超纯水作为流动相,流速为1 mL·min−1,柱温箱温度为80 ℃,进样量为5 µL。通过碳水化合物组分的标准品及外标法进行定量分析,各组分含量单位以mg·g−1 DW表示。

    选择烟草Actin基因[13]作为内源参照基因进行拷贝数估算,参照王盛等[14]的方法,利用SYBR Green 实时荧光定量PCR法检测转基因烟草植株中外源As6G-FFT基因的拷贝数。以野生型烟草K326的基因组DNA为内参基因标准品,紫外分光光度计测得质量浓度为0.040 6 μg·μL−1,将其进行5倍梯度稀释,稀释倍数分别为50、51、52、53和54,使用NtACT引物进行PCR扩增。同时以含有As6G-FFT基因的质粒为外源基因标准品,紫外分光光度计测得质量浓度为0.035 6 μg·μL−1,将其进行5倍梯度稀释,稀释倍数同上,后使用As6G-FFT引物进行PCR扩增。反应体系与程序同1.4,最后制作内参基因和外源基因实时荧光定量PCR的标准曲线。

    以1株野生型烟草和14株PCR检测为阳性的转As6G-FFT基因烟草植株基因组DNA为模板,对转基因烟草中As6G-FFT基因表达进行定量分析。使用As6G-FFT引物进行PCR扩增,设1个空白对照,每个样品3次技术重复,同时,分别以14株转As6G-FFT基因烟草植株和1株WT烟草植株的基因组DNA为模板,对转基因烟草中内参基因表达进行定量分析。使用NtACT引物进行PCR扩增,设1个空白对照,每个样品3次技术重复。反应体系与程序同1.4。

    选取转基因烟草幼嫩叶片进行基因组DNA的提取,经质检合格后,使用As6G-FFT基因克隆引物(表1)对其进行PCR扩增。结果显示14个转基因烟草叶片均能扩增出目的片段,而野生型烟草中未检测到目的条带(图1),说明14个转基因烟草株系中已成功转入目的基因As6G-FFT

    图  1  As6G-FFT基因烟草PCR检测
    M:DNA分子量标准(2 000 bp);WT:野生型烟草;N1~N14:转基因烟草株系。下同。
    Figure  1.  PCR detection of As6G-FFT in transgenic tobacco plants
    M: DNA marker (2 000 bp); WT: wild-type tobacco; N1-N14: transgenic tobacco lines. Same for the following.

    为了分析转基因烟草中As6G-FFT基因的表达水平,以组培苗移栽后30 d烟草叶片为材料,提取14个转基因烟草株系和野生型烟草叶片的RNA并反转为cDNA,然后利用qRT-PCR技术分析As6G-FFT基因的表达量(图2)。结果显示,与WT相比,14个转基因株系中有7个株系(N3、N4、N5、N9、N10、N11、N14)表达量极其显著上升(P<0.001),其余7个株系均达到极显著上升水平(P<0.01)。总体而言,转基因株系中的As6G-FFT基因表达量比野生型高1.17~215.13倍。表明将大蒜As6G-FFT基因过表达转入烟草后转基因烟草株系中As6G-FFT基因表达量呈极显著水平上升。

    图  2  As6G-FFT基因烟草的基因表达量
    **:差异极显著(P<0.01);***:差异极其显著(P<0.001)。图3同。
    Figure  2.  As6G-FFT expressions in transgenic and wild-type tobacco plants
    **: extremely significant difference (P<0.01), ***: extremely significant difference (P<0.001) ; The same as Fig.3.

    进一步测定14个转As6G-FFT基因烟草株系的果聚糖含量(图3)。结果发现,14个转基因株系的果聚糖含量都高于野生型烟草,其中有13个转基因株系的果聚糖含量呈极其显著升高(P<0.001),1个转基因株系(N7)的果聚糖含量显著升高(P<0.01),而野生型烟草中几乎没有果聚糖。转基因株系的果聚糖含量比野生型显著提高了1.51~10.47倍。以上结果表明转基因烟草中As6G-FFT催化了果聚糖的合成。

    图  3  As6G-FFT基因烟草的果聚糖含量
    Figure  3.  Fructan contents in transgenic and wild-type tobacco plants

    转基因植物中外源基因的拷贝数是影响其表达水平及稳定遗传的关键。因此,本研究利用实时荧光定量PCR技术,以烟草Actin基因为内参,建立As6G-FFT基因拷贝数鉴定方程。根据Ct值与对应模板拷贝数对数值间的线性关系,以Ct值为横坐标、起始模板拷贝数的对数为纵坐标,分别获得内参基因和外源基因标准品实时荧光定量PCR的标准曲线(图4)。As6G-FFT基因实时荧光定量PCR的标准曲线为y=−0.290 7x+3.014 5(R2=1),NtACT基因实时荧光定量PCR的标准曲线为y=−0.281 3x+8.014 1(R2=1)。两个基因标准曲线相关系数均接近于1,表明检测样品所得的结果准确可信。

    图  4  As6G-FFTNtACT基因实时荧光定量PCR的标准曲线
    A:As6G-FFT基因;B:NtACT基因。图5、6同。
    Figure  4.  Real-time fluorescent quantitative PCR standard curves of As6G-FFT and NtACT
    A: As6G-FFT; B: NtACT. Same for Fig. 5, 6.

    As6G-FFTNtACT基因实时荧光定量PCR熔解曲线如图5所示,As6G-FFTNtACT基因熔点分别为83.70和80.17,熔解曲线均为单峰,说明引物特异性强,在反应中无引物二聚体等非特异性扩增,即测得的试验数据准确可信。

    图  5  As6G-FFTNtACT基因实时荧光定量PCR的熔解曲线
    Figure  5.  Real-time fluorescent quantitative PCR melting curves of As6G-FFT and NtACT

    外源基因As6G-FFT的扩增结果如图6-A所示,除空白对照未扩增出荧光曲线外,其余被测的烟草植株样品均扩增出荧光曲线,表明样品未被污染,检测结果可信。内参基因NtACT的扩增结果如图6-B所示,转基因烟草植株样品均扩增出荧光曲线,而野生型烟草植株和空白对照均未扩增出荧光曲线。

    图  6  As6G-FFTNtACT基因实时荧光定量PCR的扩增曲线
    Figure  6.  Real-time fluorescent quantitative PCR amplification curves of As6G-FFT and NtACTs

    对14株PCR检测为阳性的转As6G-FFT基因烟草植株和1株野生型烟草植株的As6G-FFTNtACT基因进行实时荧光定量PCR分析,所得Ct值和Tm值如表2所示。通过标准曲线计算Ct值对应模板浓度的对数值,再根据外源基因和内参基因模板浓度对数值的比值绝对值估算出外源基因的拷贝数,计算结果如表2所示,检测的14株转As6G-FFT基因烟草植株的最低拷贝数为1,最高拷贝数达到3个,其中1拷贝单株数5株,占总转基因株数的35.7%;2拷贝单株数7株,占总转基因株数的50%;3拷贝单株数2株,占总转基因株数的14.3%;而野生型烟草植株的As6G-FFT基因拷贝数为0。

    表  2  转基因烟草中As6G-FFT基因拷贝数
    Table  2.  Copy number of As6G-FFT in transgenic tobacco plants
    转基因烟草
    Transgenic tobacco
    As6G-FFT基因
    As6G-FFT gene
    NtACT基因
    NtACT gene
    浓度对数值的比值
    Log value ratio of concentration
    拷贝数
    Copy number
    Ct熔解温度
    Tm
    浓度对数值
    Log value of concentration
    Ct熔解温度
    Tm
    浓度对数值
    Log value of concentration
    N1 19.14 83.81 2.55 20.60 80.13 2.22 1.15 1
    N2 20.44 83.67 2.93 23.40 80.12 1.43 2.04 2
    N3 20.81 83.70 3.03 20.78 80.10 2.17 1.40 1
    N4 21.08 83.79 3.11 20.62 80.25 2.21 1.41 1
    N5 21.66 83.73 3.28 23.57 80.23 1.38 2.37 2
    N6 20.62 83.60 2.98 21.76 80.04 1.89 1.57 2
    N7 19.72 83.61 2.72 21.53 80.23 1.96 1.39 1
    N8 18.98 83.78 2.50 21.33 80.38 2.01 1.24 1
    N9 23.51 83.75 3.82 23.82 80.19 1.31 2.91 3
    N10 22.48 83.66 3.52 22.39 80.08 1.71 2.05 2
    N11 22.46 83.79 3.51 21.78 80.21 1.89 1.86 2
    N12 21.80 83.84 3.32 22.60 80.29 1.66 2.01 2
    N13 22.76 83.69 3.60 22.75 80.12 1.61 2.23 2
    N14 22.72 83.66 3.59 23.42 80.03 1.43 2.52 3
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    植物遗传转化是农作物改良和基因功能研究的常用试验方法。本研究在课题组前期工作基础上,对转As6G-FFT基因烟草T0代进行了筛选与阳性鉴定,共获得14个阳性转基因烟草株系。研究表明过表达植株后代中外源基因拷贝数是影响目的基因表达水平和遗传稳定性的主要因素,拷贝数越低,遗传稳定性越高。因此,获得阳性转基因植株后,对其外源基因拷贝数进行检测分析具有重要意义。

    实时荧光定量PCR检测外源基因拷贝数是近几年迅速发展起来的外源基因拷贝数检测新方法,目前已在柑橘、烟草、玉米、水稻等多种作物中应用[15-18],其中SYBR Green荧光染料由于成本低、简单易用、灵敏度高,而被广泛采用[10,19-20]。本研究利用SYBR Green法成功对14个转As6G-FFT基因烟草株系的As6G-FFT拷贝数进行了实时荧光定量PCR检测,得出了As6G-FFT基因的整合特点,其中具有1、2和3个拷贝的单株数分别占植株总数的35.7%、50.0%和14.3%,且1~2个拷贝的单株数占整个转基因植株的85.7%,这与文献报道中提到的,农杆菌介导转化,一般外源基因以低拷贝(1~2)整合为主(占70%以上)的结果一致。Tan等[21]检测15份转基因植株拷贝数,其中1~2拷贝的单株数占总数的86.6%;Wen等[22]对26株转基因柑橘进行拷贝数分析,结果表明1~2拷贝整合数量占整个转基因植株的73%;魏毅东等[23]对9个OsPIMT1转基因水稻T0代植株进行拷贝数检测,其中6个为单拷贝,3个为双拷贝;杜京尧等[24]采用实时荧光定量PCR技术检测OsRhoGDI2转基因水稻中的外源基因拷贝数,结果显示OsRhoGDI2在过表达转基因水稻中均为单拷贝。由此说明采用实时荧光定量PCR检测转基因拷贝数具有简单、高效、方便、准确等优点。此外,烟草是植物基因功能研究的模式植物,应用该方法检测并筛选单拷贝数的转基因烟草,可为今后转基因拷贝数研究提供一种新的检测技术。

    本研究首先采用基因组DNA扩增的方法,检测As6G-FFT基因是否均已稳定整合到烟草基因组中,进而采用定量PCR技术在转录水平检测As6G-FFT在转基因烟草中的表达水平。结果显示As6G-FFT基因表达量水平显著高于野生型;此外,分别提取了野生型和转基因烟草中的果聚糖含量,发现果聚糖含量在转基因烟草中的积累要显著高于野生型。以上对转基因烟草在基因水平、转录水平及生理水平的分析结果均一致表明,As6G-FFT过表达载体已整合到烟草基因组。最后通过实时荧光定量PCR法检测阳性转基因烟草中As6G-FFT的拷贝数,发现外源As6G-FFT基因整合到烟草中的低拷贝(1~2)单株数占整个转基因植株的85.7%。本研究分析鉴定了14个转As6G-FFT基因烟草株系,获得了低拷贝(1~2)的阳性转As6G-FFT基因烟草株系,为后续As6G-FFT基因功能分析提供稳定遗传材料,同时也为植物外源基因拷贝数分析提供技术支撑。

  • 图  1   As6G-FFT基因烟草PCR检测

    M:DNA分子量标准(2 000 bp);WT:野生型烟草;N1~N14:转基因烟草株系。下同。

    Figure  1.   PCR detection of As6G-FFT in transgenic tobacco plants

    M: DNA marker (2 000 bp); WT: wild-type tobacco; N1-N14: transgenic tobacco lines. Same for the following.

    图  2   As6G-FFT基因烟草的基因表达量

    **:差异极显著(P<0.01);***:差异极其显著(P<0.001)。图3同。

    Figure  2.   As6G-FFT expressions in transgenic and wild-type tobacco plants

    **: extremely significant difference (P<0.01), ***: extremely significant difference (P<0.001) ; The same as Fig.3.

    图  3   As6G-FFT基因烟草的果聚糖含量

    Figure  3.   Fructan contents in transgenic and wild-type tobacco plants

    图  4   As6G-FFTNtACT基因实时荧光定量PCR的标准曲线

    A:As6G-FFT基因;B:NtACT基因。图5、6同。

    Figure  4.   Real-time fluorescent quantitative PCR standard curves of As6G-FFT and NtACT

    A: As6G-FFT; B: NtACT. Same for Fig. 5, 6.

    图  5   As6G-FFTNtACT基因实时荧光定量PCR的熔解曲线

    Figure  5.   Real-time fluorescent quantitative PCR melting curves of As6G-FFT and NtACT

    图  6   As6G-FFTNtACT基因实时荧光定量PCR的扩增曲线

    Figure  6.   Real-time fluorescent quantitative PCR amplification curves of As6G-FFT and NtACTs

    表  1   引物序列

    Table  1   Primer sequence

    引物
    Primer
    引物序列
    (5′-3′) Primer sequence
    目的
    Purpose
    As6G-FFT-clone F: ATGGATGCTCAAGACATTGAG
    TC
    阳性PCR检测
    Positive PCR detection
    R: TTAAAAATGATAAAAATCATTG
    TAAGTGGAGTTC
    As6G-FFT F: TGGCTCTTTACGCACTCA 实时荧光定量
    PCR分析
    qRT-PCR analysis
    R: TCGCACTCGTCCTACCTC
    NtACT F: AATGATCGGAATGGAAGCTG
    R: TGGTACCACCACTGAGGACA
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    表  2   转基因烟草中As6G-FFT基因拷贝数

    Table  2   Copy number of As6G-FFT in transgenic tobacco plants

    转基因烟草
    Transgenic tobacco
    As6G-FFT基因
    As6G-FFT gene
    NtACT基因
    NtACT gene
    浓度对数值的比值
    Log value ratio of concentration
    拷贝数
    Copy number
    Ct熔解温度
    Tm
    浓度对数值
    Log value of concentration
    Ct熔解温度
    Tm
    浓度对数值
    Log value of concentration
    N1 19.14 83.81 2.55 20.60 80.13 2.22 1.15 1
    N2 20.44 83.67 2.93 23.40 80.12 1.43 2.04 2
    N3 20.81 83.70 3.03 20.78 80.10 2.17 1.40 1
    N4 21.08 83.79 3.11 20.62 80.25 2.21 1.41 1
    N5 21.66 83.73 3.28 23.57 80.23 1.38 2.37 2
    N6 20.62 83.60 2.98 21.76 80.04 1.89 1.57 2
    N7 19.72 83.61 2.72 21.53 80.23 1.96 1.39 1
    N8 18.98 83.78 2.50 21.33 80.38 2.01 1.24 1
    N9 23.51 83.75 3.82 23.82 80.19 1.31 2.91 3
    N10 22.48 83.66 3.52 22.39 80.08 1.71 2.05 2
    N11 22.46 83.79 3.51 21.78 80.21 1.89 1.86 2
    N12 21.80 83.84 3.32 22.60 80.29 1.66 2.01 2
    N13 22.76 83.69 3.60 22.75 80.12 1.61 2.23 2
    N14 22.72 83.66 3.59 23.42 80.03 1.43 2.52 3
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出版历程
  • 收稿日期:  2022-01-11
  • 修回日期:  2022-03-22
  • 录用日期:  2022-01-11
  • 网络出版日期:  2022-04-23
  • 刊出日期:  2022-05-27

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