龙眼ISSR-PCR反应体系的优化及指纹图谱初探

姜帆; 高慧颖; 陈秀萍; 李韬; 杨凌; 郑少泉

龙眼ISSR-PCR反应体系的优化及指纹图谱初探

姜帆^1,2,
高慧颖^1,3,
陈秀萍^1,2,
李韬^1,2,
杨凌²,
郑少泉^2, ,

1.
福建省果树(龙眼、枇杷)育种工程技术研究中心, 福建, 福州, 350013;
2.
福建省农业科学院果树研究所, 福建, 福州, 350013;
3.
河北工程大学农学院, 河北, 邯郸, 057150

基金项目:

福建省农业科技重大专项(2004NE02-1);福建省财政专项资助(STIF-Y06)

详细信息

通讯作者:
郑少泉(1964- ),男,研究员,从事龙眼、枇杷种质资源、育种及品质生物技术研究(E-mail:ZSQ333555@163.com).

中图分类号: S667.2
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出版历程
- 收稿日期: 2007-06-07
- 修回日期: 2007-08-09
- 刊出日期: 2007-09-14

Inter simple sequence repeats system optimization and fingerprinting for Longan

1.
Fujian Breeding Engineering Technology Research Center for Longan and Loquat, Fuzhou, Fujian 350013, China;
2.
Pomology Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou, Fujian 350013, China;
3.
Agricultural college, Hebei University of Engineering, Handan, Hebei 057150, China

摘要

摘要: 以立冬本龙眼DNA为模板研究了龙眼ISSR-PCR反应体系的主要成分对ISSR扩增结果的影响,并探讨了构建龙眼指纹图谱的可行性。结果表明:在25μL的PCR反应体系中Mg2+的最适浓度为2.0mmol·L-1;dNTP最适浓度为0.2mmol·L-1;引物的最适浓度为0.7μmol·L-1;模板20ng;TaqDNA聚合酶用量为1.5U。利用优化后的反应体系对福建不同地区龙眼基因型进行了ISSR扩增,扩增产物在250bp～2kb;利用丰富的多态性DNA谱带构建了12个基因型龙眼的指纹图谱。
- 龙眼 /
- ISSR-PCR /
- 优化 /
- 指纹图谱
Abstract: Factors affecting the Inter-Simple Sequence Repeats (ISSR) analysis of longan,such as annealing temperature and concentrations of template DNA,Mg2 + and dNTP were examined.The optimal ISSR-PCR reaction system (25 μL) was found to be: 20 ng template DNA,1.5 U Taq DNA polymerase,0.7 μmol·L-1 primer,2.0 mmol·L-1 Mg2+,and 0.2 mmol·L-1 dNTPs.Using the single primer (ISSR-13),fingerprints of 12 genotypes were constructed from different origins with their abundant polymorphism of DNA spectra.The results suggested that ISSR-PCR could be a suitable reaction system for studying longan genetic diversity.
- Longan /
- ISSR-PCR /
- optimization /
- fingerprint

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参考文献(5)

ZIE DEWIEZ E,RAFALSKI A,LABU DA D.Genome fingerprinting by simple sequence repeart (SSR) an hored polymerase chain reaction amplification[J].Genomics,1994,20:176-183.

SANTRA D K,TEKEOGLU M,RATNAPARK,et al.Identification and mapping of QTLs conferring resistance to ascochyta blight in chickpea[J].Crop Sci,2000,40:1606-1612.

葛永奇,邱英雄,丁炳扬,等.孑遗植物银杏群体遗传多样性的ISS分析[J].生物多样性,2003,(4):276-287.

余艳,陈海山,葛学军.简单重复序列区间(ISSR)引物反应条件优化与筛选[J].热带亚热带植物学报,2003,11(1):15-19.

高慧颖,姜帆,陈秀萍,等.龙眼代表性品种RAPD分析[J].福建林业科技,2007,34(1):74-78.

施引文献

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龙眼ISSR-PCR反应体系的优化及指纹图谱初探

通讯作者: 郑少泉(1964- ),男,研究员,从事龙眼、枇杷种质资源、育种及品质生物技术研究(E-mail:ZSQ333555@163.com).

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Inter simple sequence repeats system optimization and fingerprinting for Longan

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通讯作者:
郑少泉(1964- ),男,研究员,从事龙眼、枇杷种质资源、育种及品质生物技术研究(E-mail:ZSQ333555@163.com).